Suojaaminen tapahtuu asettamalla dokumentille salasana.

Jos käytät Adobe Acrobatia niin suositeltavaa on tallettaa suojattava pdf ensin toisella nimellä että muokattava dokumentti on aina saatavilla, jos suojaussalasana sattuu unohtumaan. Eli tiedostosta on muokattava versio ja jaeltava versio.

PDF-Xhangen PDFTools tekee tämän osana työnkulkua.